Le attività di programmazione e coordinamento vengono realizzate su diversi livelli che corrispondono ai rispettivi organi istituzionali di cui si compone il Sistema bibliotecario:

• Presidente: ruolo ricoperto dall'Assessore alla Cultura della Comunità Montana di Valle Camonica, svolge compiti di carattere istituzionale e di indirizzo generale.


• Assemblea dei Comuni: organo di indirizzo politico/amministrativo del Sistema Bibliotecario, esso si riunisce almeno due volte all'anno e svolge compiti consultivi e propositivi.
  Ad essa partecipa di diritto il presidente del Sistema e il Sindaco (o suo delegato) di ogni comune aderente e in tale ambito si fissano le linee programmatiche generali dell'attività sistemica.


• Comitato tecnico: organismo tecnico del Sistema Bibliotecario, nel suo ambito si definisce la programmazione sistemica e si verifica lo stato dei servizi. Esso, presieduto dal Direttore, si riunisce mensilmente, presso il Centro operativo del Sistema, e vede la partecipazione di tutti i bibliotecari che gestiscono i servizi della Valle.